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正常人類細(xì)胞類型的DNA甲基化圖譜 ,德國MB助力科研

更新時間:2023-02-22  |  點擊率:496

DNA甲基化是一種基本的表觀遺傳標(biāo)記,支配基因表達(dá)和染色質(zhì)組織,從而為細(xì)胞身份和發(fā)育過程提供了一個窗口。目前的數(shù)據(jù)集通常只包括甲基化位點的一小部分,并且通?;谠谂囵B(yǎng)中發(fā)生了巨大變化的細(xì)胞系或包含不確定的細(xì)胞混合物的組織。

近日,研究人員描述了一個基于深度全基因組亞硫酸氫鹽測序的人類甲基組圖譜,允許對從205個健康組織樣本中分類的39種細(xì)胞類型的數(shù)千個標(biāo)記進(jìn)行片段級分析。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《Nature》上,文章標(biāo)題為:“A DNA methylation atlas of normal human cell types"。

相同細(xì)胞類型的復(fù)制具有99.5%以上的同一性。圖譜的無監(jiān)督聚類概括了組織個體發(fā)生的關(guān)鍵要素,并確定了自胚胎發(fā)育以來保留的甲基化模式。在單個細(xì)胞類型中未甲基化的位點通常位于轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子中,并包含組織特異性轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的DNA結(jié)合位點。高甲基化位點是罕見的,并且在CpG島、Polycomb靶點和CTCF結(jié)合位點上富集,這表明在形成細(xì)胞類型特異性染色質(zhì)環(huán)方面具有新的作用。該圖譜為基因調(diào)控和疾病相關(guān)遺傳變異的研究提供了必要的資源,并為液體活檢提供了大量潛在的組織特異性生物標(biāo)志物。

DNA實驗室,對于環(huán)境的潔凈度要求比較高,稍不注意,DNA酶、RNA酶以及雜質(zhì)DNA就會影響實驗結(jié)果。定期祛除這類污染,對于DNA實驗而言至關(guān)重要。MB大面積DNA污染 清除劑,用于日常的實驗室清潔,祛除大面積如地板上的DNA。它采用的是無致癌性的DNA破壞化學(xué)原理。該溶液包含一種表面活性劑和一種DNA/RNA破壞劑,非堿類,非致癌類因子。使用后,DNA和RNA在數(shù)秒內(nèi)去除。


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